Çoğu kaynakta 1576 yılında doğduğu söylenmektedir.Aslen Rum olan Handan Sultan’ın gerçek isminin Helen olduğu da kayıtlarda geçmektedir.1. Ahmed’in 1603 yılında tahta çıkmasına rağmen Büyük Valide Sultan olan Safiye Sultan’ın hayatta olması onun gücünü ve saltanata etkisini kırmıştır.Safiye Sultan hayatta olduğu müddetçe ondan daha az maaş almış ve haremi yönetme gücüne pek fazla sahip olamamıştır.
Oğlunun küçük yaşta tahta geçmesi sebebiyle bazı konularda devlet işlerine müdahil olduğunu söylemek mümkündür.Fakat bu müdahilliğin 1605 yılında vefat etmesiyle kısa sürdüğü de söylenebilir.